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中國(guó)完成短花藥野生稻基因組測(cè)序及分析

時(shí)間:2013-03-22     來(lái)源:世界農(nóng)化網(wǎng)
稻屬是從事植物比較、進(jìn)化和功能基因組學(xué)研究的理想系統(tǒng)。野生稻蘊(yùn)含著寶貴的基因資源。為了更好地利用稻屬的野生資源,美國(guó)亞利桑那大學(xué)的Rod Wing教授在2009年發(fā)起了國(guó)際稻屬基因組計(jì)劃(I-OMAP),旨在構(gòu)建稻屬所有物種的全基因組序列圖譜,并在此基礎(chǔ)上開(kāi)展比較、進(jìn)化和功能基因組學(xué)研究。

  在I-OMAP計(jì)劃的框架下,中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所陳明生課題組通過(guò)與深圳華大基因、亞利桑那大學(xué)等合作,利用第二代測(cè)序技術(shù)完成了261 Mb高質(zhì)量的短花藥野生稻(O.brachyantha)全基因組序列,并開(kāi)展了稻屬比較基因組學(xué)和基因組進(jìn)化的研究。研究揭示了稻屬基因組在基因組大小、基因移動(dòng)和異染色質(zhì)進(jìn)化等方面新的分子機(jī)制。該研究于3月12日在線(xiàn)發(fā)表于Nature Communications。